وقسمي المدرسة هما القسم الشمالي الشرقي والقسم الشمالي الغربي الذى جددت مبانيه فى عصر سعيد باشا سنة 1272 هـ / 1856م ، وقد شغل مباني هذه المدرسة جنود الاحتلال الإنجليزى عند احتلالهم لمصر سنة 1882م واستخدموها كما هو موقع على خريطة القلعة لسنة 1897م كمكاتب
للرقابة والتأديب وكاتب للضباط وقاعة للأطفال ، وبعد خروج الإنجليز من القلعة سنة 1946م فى عهد الملك فروق الأول استخدمت مباني المدرسة كمخازن للمهمات التابعة الجيش المصري حتي سنة 1984م عند تطوير القلعة إذ قامت هيئة الآثار - المجلس الأعلى للآثار - بترميم هذا المبني الذى كان فى حالة سيئة فى ذلك الوقت